共有ディレクトリのパーミッション設定をしたい場合はVagrantfileを修正するようでした。
Vagrantfileに以下を記載↓
config.vm.synced_folder"./","/vagrant",:owner =>"apache",:group =>"apache",:mount_options => ["dmode=775,fmode=775"]
$ vagrant reload
で再起動したら共有ディレクトリに入れました。
あっさり解決できて良かった。
参考にさせていただいたサイト様

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